Fri, 07 Aug | Webex オンラインイベント

GPU と Parabricks による全ゲノム解析の超高速化とライフサイエンス研究の進化

この度「GPU と Parabricks による全ゲノム解析の超高速化とライフサイエンス研究の進化」と題しまして、スパコン SHIROKANE で利用可能な ゲノムシークエンスデータ解析パイプライン Parabricks の講義を開催しますのでご案内します。
お申し込みの受付は終了しました。

日時・場所

07 Aug 2020, 13:00 – 14:30
Webex オンラインイベント

イベントについて

動画と資料

終了した講習会は録画での提供になります。これらのファイルの閲覧には SHIROKANE のアカウントでのログインが必要です。これらのファイルの再利用、再配布は禁止です。

 

  • 日程: 2020 年 8 月 7 日 (金)
  • 講義時間: 13 時 00 分 ~ 14 時 30 分
  • 会場: Webex によるオンライン開催
  • 定員: 150 名 
  • 参加費: 無料
  • 本講習会は日本語で実施します

講習題目

GPU と Parabricks による全ゲノム解析の超高速化とライフサイエンス研究の進化

講師

NVIDIA 阮 佩穎 (ゲン ハイエイ) 講師

NVIDIA Clara Parabricks ソフトウェアは GPU による高速計算を活用して、GATK と等価のヒト全ゲノム二次解析パイプライン全体を 40 ~ 50 分程度で処理することを可能にしました。 さらにシングルセル RNA 解析に向けて STAR や STAR Fusion による マッピングの高速化、t-SNE など三次解析に有益な解析計算の高速化も実装が進んでいます。  

本講習会では、スパコン SHIROKANE の GPU ノード上でこの Parabricks ソフトウェアを利用し、高速二次解析処理を行う具体的な操作方法をご紹介します。 さらにゲノム分野だけにとどまらず、様々なライフサイエンス研究分野に向けた GPU の有効活用の可能性、将来像を概説します。  

申込み方法  8 月 6 日 (木) 17:00 までに下記フォームから申し込みください。登録いただいたメールアドレスに Webex の URL をご連絡します。システム上、チケットの販売といった表記となりますが無償の講習会です。

講習会開催中のご質問は、Webex のチャットで受付いたします。

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