Anonymous FTP
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ヒトゲノム解析センターで開発されたデータベースやソフトウェアをダウンロードすることができます。また Anonumous FTP サーバでは、いくつかのデータベースをミラーしています。
HGC 提供のデータベース
他研究機関提供のデータベース
1000 Genomes
1000 人ゲノムプロジェクトで得られたゲノムデータのうち、日本人のゲノムデータ (Population が JPT のもの) が利用できます。
NCBI
NCBI で公開されているデータベースで、GenBank, RefSeq, UniGene の他に Genomes, dbSNP, Taxonomy, OMIM, GEO などが利用できます。
EMBL
EMBL/EBI による核酸配列のデータベースです。内容は GenBank、 DDBJ と共通です。
UniProt
Swiss Prot、 TrEMBL、 PIR データベースを統合して作られた、SIB/EBI によるアミノ酸配列のデータベースです。
Pfam, Rfam
Pfam: Washington 大学と Sanger Institute によるタンパク質ファミリーのデータベースです。
Rfam: Washington 大学と Sanger Institute による機能性 RNA ファミリーのデータベースです。
他研究機関提供のソフトウェア
NCBI
NCBI の相同性検索プログラム BLAST と、BLAST の検索対象となる EST, nr などのデータベースです。
FASTA
Virginia 大学の相同性検索プログラムで SSEARCH 等も含まれます。
ClustalW, ClustalX
ClustalW：マルチプルアラインメントのプログラムです。
ClustalX：ClustalW のグラフィカルインターフェイス (GUI) です。
PHYLIP
系統解析のプログラムです。
HMMER, INFERNAL
HMMER: 隠れマルコフモデル (HMM) を作成し配列を検索するプログラムです。
INFERNAL: RNA の共分散モデル (CM) を作成し配列を検索をするプログラムです。
EMBOSS
配列解析を中心とした多数のプログラム集です。
InterProScan
InterPro データベースを検索するプログラムです。
exonerate, Wise2
exonerate: 相同性検索とゲノム等への配列マッピングを行う統合プログラムです。
Wise2: タンパク質のゲノムへのマッピングを行うプログラムです。
MEME
期待値最大化 (EM) 法により配列から特徴パターンを検索するプログラムです。