データベース

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ヒトゲノム解析センターでは、様々なデータベースを構築しています。また、我々が開発したシステムにより、いくつかの他機関で構築されている主要なデータベースも、検索することができます。

Rat Genome Map

大塚製薬 GEN 研究所らによる OLETF ラットの放射線ハイブリッドマップです。

Full-malaria

Full-malaria は、寄生虫の完全長 cDNA データベースです。マラリア原虫 (赤血球感染型)、トキソプラズマ原虫 (タキゾイト) の発現遺伝子の 5' 端塩基配列をゲノムシークエンス上にマップして表示しています。エキノコックス (多包条虫) の嚢包の完全長 cDNA の 5' 端塩基配列も公開しています。

ATTED-II

ATTED-II は、公共のデータベースに蓄積しているシロイヌナズナのマイクロアレイデータから計算した遺伝子共発現情報を公開しているデータベースです。

COXPRESdb

COXPRESdb は、公共のデータベースに蓄積しているヒト、マウス、ラットのマイクロアレイデータから計算した遺伝子共発現情報を公開しているデータベースです。

DBTBS

HGC を中心としたグループによる、枯草菌の転写因子とプロモーターの情報を文献から抽出したデータベースです。

DBTGR

ホヤ等の被嚢類の転写因子とプロモータの情報を、文献より抽出したデータベースです。カタユウレイボヤとマボヤのプロモータ領域の保存度も比較できます。

MBGD

MBGD は、バクテリアの完全ゲノム配列を比較解析するためのデータベースです。 MBGD の目的は、オーソログ遺伝子の同定、パラログ遺伝子のクラスタリング、モチーフ解析、遺伝子の並びの比較などの、様々な観点から比較ゲノムをやりやすくすることです。現在では、基礎生物学研究所で管理されています。

BSORF

JAFAN (枯草菌の日本機能解析ネットワーク) による枯草菌 ORF データベースです。