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データベース
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ヒトゲノム解析センターでは、様々なデータベースを構築しています。また、我々が開発したシステムにより、いくつかの他機関で構築されている主要なデータベースも、検索することができます。
Full length cDNA
NEDO の支援を受けたバイオテクノロジー開発技術研究組合との共同事業 (菅野教授のグループ) による完全長 cDNA のデータベースです。
Aberrant Splicing Database
中井教授 (HGC) が以前収集した異常スプライシング (突然変異などでスプライシングに異常が起こり発病する) のコレクションです。
Hintdb/HitPredict
Hintdb は、実験的に得られた 9 生物種間のタンパク質-タンパク質相互作用のデータベースです。
HitPredict は、ハイスループットデータから予測されたタンパク質-タンパク質相互作用のデータベースです。
CSML/CSO
DBTSS
DBTBS
DBTGR
Full length cDNA
Aberrant Splicing Database
Hintdb/HitPredict
eF-site
Rat Genome Map
Full-malaria
MBGD
BSORF
ATTED-II
COXPRESdb
Full-malaria
Full-malaria は、寄生虫の完全長 cDNA データベースです。マラリア原虫 (赤血球感染型)、トキソプラズマ原虫 (タキゾイト) の発現遺伝子の 5' 端塩基配列をゲノムシークエンス上にマップして表示しています。エキノコックス (多包条虫) の嚢包の完全長 cDNA の 5' 端塩基配列も公開しています。
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