GPU と Parabricks による全ゲノム解析の超高速化とライフサイエンス研究の進化

• 日程: 2023 年 8 月 29 日 (火)
• 講義時間: 13 時 00 分 ～ 15 時 00 分
• 会場: Webex によるオンライン開催
• 定員: 100 名 
• 参加費: 無料
• 本講習会は日本語で実施します

講習題目

GPU と Parabricks による全ゲノム解析の超高速化とライフサイエンス研究の進化

講師

NVIDIA 阮 佩穎 (ゲン ハイエイ) 講師

NVIDIA Clara Parabricks ソフトウェアは GPU による高速計算を活用して、GATK と等価のヒト全ゲノム二次解析パイプライン全体を 40 ～ 50 分程度で処理することを可能にしました。 さらにシングルセル RNA 解析に向けて STAR や STAR Fusion による マッピングの高速化、t-SNE、UMAP など三次解析に有益な解析計算の高速化も実装が進んでいます。  

本講習会では、スパコン SHIROKANE の GPU ノード上でこの Parabricks ソフトウェアを利用し、高速二次解析処理を行う具体的な操作方法をご紹介します。 さらにゲノム分野だけにとどまらず、様々なライフサイエンス研究分野に向けた GPU の有効活用の可能性、将来像を概説します。  

申込み方法  8 月 28 日 (月) 17:00 までに下記フォームから申し込みください。登録いただいたメールアドレスに Webex の URL をご連絡します。システム上、チケットの販売といった表記となりますが無償の講習会です。

講習会開催中のご質問は、Webex のチャットで受付いたします。