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2008 年の記事

最終更新: 5月2日


2008年11月10日 GeneCards バージョンアップ


GeneCards を ver 2.38.1 から ver 2.39 にバージョンアップいたしました。 ヒトゲノム解析センターの GeneCards ミラーサイトはこちらです。

2008年09月19日 オープンバイオ講習会開催のお知らせ


9 月 25 日午後開催の「オープンバイオ講習会」の受講者を募集しております。 講習会内容、申し込み方法は下記をご参照ください https://supcom.hgc.jp/japanese/training/calender.html

2008年09月08日 Accelrys GCG DB 更新のお知らせ(9/19)


GCG および SeqWeb について、下記の日程でデータ更新作業を実施させていただきます。 ■2008 年 9 月 19 日 (金) 9:00 ~ 24:00 上記作業中は GCG および SeqWeb のご利用ができなくなります。ご理解、ご協力の程、よろしくお願いいたします。

2008年08月01日 統計処理言語 R 講習会開催のお知らせ


8 月 6 日、7 日開催の「統計処理言語 R 講習会」の受講者を募集しております。 講習会内容、申し込み方法は下記をご参照ください https://supcom.hgc.jp/japanese/training/calender.html

2008年07月17日 GCG サービス終了のお知らせ


当センターのサービスのひとつとして長らくお使いいただいておりました GCG パッケージが、2008 年限りでご利用いただけなくなります。 スパコンシステムでは、すでに GCG の代替としてフリーの互換ソフトウェアである EMBOSS パッケージの提供を開始しておりますが、ご利用のありました GCG コマンドについて、対応する EMBOSS コマンドの対応表を作成いたしましたので、ご参照いただければ幸いです。

commandpdf

2008年06月28日 ネットワークメンテナンスのお知らせ


以下の日時にネットワークメンテナンスを実施するため、東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターとインターネット間の通信が一時停止します。 2008 年 7 月 12 日 01:00-03:00 この時間帯は、インターネットからスパコンシステムにログインできません。医科学研究所内の総合研究棟6-8階、旧ゲノム解析センター棟、およびヒトゲノム解析センター棟からはログインできます。 該当時間前には以下の対策を実施してください。

  • テキストファイルを編集している場合は保存してください。

  • 通信が停止した場合、プログラムは kill されます。ジョブの実行計画を調整してください。

ご迷惑をお掛けしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。


Announcement


Because of network maintenance, the network between Human Genome Center (HGC) and the Internet will stop at the following date.


12th July, 2008 01:00-03:00 (JST)


During this time, you can not log on Supercomputers from the Internet. It is possible to log on from only HGC and a part of Institute of Medical Science (General Research Building 6-8F and Human Genome Center (annex))


So before this maintenance, please confirm the following:

- Save your text file that you are writing

- Please confirm your job schedule. Your interactive job might be killed during this time.


Please accept our apologies for the inconvenience caused.

2008年06月10日 GeneCards バージョンアップ


GeneCards を ver 2.38 から ver 2.38.1 にバージョンアップいたしました。 ヒトゲノム解析センターの GeneCards ミラーサイトはこちらです。

2008年05月26日 Web サービス利用法講習会のお知らせ


6 月 5 日開催の「Web サービス利用法講習会」の受講者受付を開始いたしました。 講習会内容、申し込み方法は下記をご参照ください。 https://supcom.hgc.jp/japanese/training/calender.html

2008年05月21日 Sun Grid Engine サービス一時停止 (5/21)


下記作業は終了いたしました。 (2008 年 5 月 21 日 12 時 05 分) Sun Grid Engine (SGE) の緊急保守作業のため、下記の時間帯において、SGE を停止いたします。 ジョブデータベースの初期化を行うため、全ジョブは削除されます。ご迷惑をお掛けいたしますが、ご協力の程、よろしくお願いいたします。 【停止日時】 2008 年 5 月 21 日 (水) 10:00-13:00 【対象機】 samma (全 SunFire 15K, 6800) また保守作業と同時に、大量のジョブ投入による SGE への負荷軽減を目的に、ジョブ数 (実行待ちジョブ、実行中ジョブの合計数) に上限を設定いたします。 【ジョブの上限】 ユーザ当たり: 5,000 全ユーザの総数: 50,000 この上限を超えるとエラーメッセージが出力され、ジョブを投入することはできません。 大量のジョブには Array Job をご利用ください。 Array Job の使い方については、SGE 利用法 をご覧ください。 https://supcom.hgc.jp/japanese/utili_info/manual/sge.html

2008年04月21日 PC クラスタ gyoku のサービス一時停止 (4/22)


下記作業は終了いたしました。 (2008 年 4 月 22 日 12 時 35 分) PC クラスタ gyoku の /grid/gyoku 領域を提供しております NAS (Network Attached Storage) の予防保守作業を実施いたします。 以下の作業時間中は gyoku の全ノードを停止いたしますので、ご了承ください。 【作業日時】2008 年 4 月 22 日 9:30-14:00 また、既に一部のユーザの方々にはご連絡済ですが、 gyoku の /grid/gyoku 領域に配置されている重要なデータは、事前にホームディレクトリへコピーしていただけますよう、お願いいたします。

2008年03月18日 SeqWeb のサービス停止 (3/27)


SeqWeb データベース更新作業のため、3 月 27 日 (木) の午前 9 時から午後 11 時までの間、SeqWeb のご利用ができなくなります。 ご理解、ご協力の程、よろしくお願いいたします。

2008年03月10日 GeneCards バージョンアップ


GeneCards を ver 2.37 から ver 2.38 にバージョンアップいたしました。 ヒトゲノム解析センターの GeneCards ミラーサイトはこちらです。

2008年03月03日 2008 年度末更新手続き開始


★★東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター計算機システム★★ ★★ 2008 年度継続利用申請書と利用報告書の提出について ★★ 当センターのサービスを日頃ご利用くださいましてありがとうございます。 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター計算機システムの 2007 年度の利用期限は、2008 年 3 月 31 日までです。2008 年度の継続利用を希望される方、 また、今年度で登録を取り消す方も以下の要領で手続きをお願いいたします。 継続申請書の提出がない方は、2008 年 4 月以降利用資格を失い、ファイル等も消去されますのでご注意ください。 ※当センターでは 2009 年1月に新システムでの運用を開始するため、新システムへの変更作業を行います。 これに伴い、現行の計算機の利用は 2008 年 12 月までに終了を予定しています。 ご迷惑おかけして申し訳ありませんが、その旨ご了承ください。 なお、新システムへの移行スケジュールはまだ未確定な部分も多く実際のサービス停止は前後する可能性もございますのであらかじめご承知おきください。 ★申請書は以下の URL よりダウンロードしていただきますようお願いいたします。 https://supcom.hgc.jp/japanese/utili_info/procedure/nendomatsu.html 注: username@ims.u-tokyo.ac.jp のメールアカウントの年度末更新ではありません。 メールアカウントの年度末更新は IT サービス室 (MAIL: u-it@adm.ims.u-tokyo.ac.jp)で、行っております。 ●2008 年度の継続利用をされる方 「2008 年度継続利用申請書、2007 年度利用報告書」を両面印刷にてプリントアウトの上、必要事項を記入・捺印のうえ、ヒトゲノム解析センター宛にご送付ください。 ●Seqweb、Mathematica、計算機 (saba、gyoku、gomoku) 利用者 2008 年度の継続利用を希望される場合は「継続利用申請書」の該当箇所にチェックをお願いいたします。 SeqWeb の利用期限は 2008 年 12 月末までです。 Mathematica、計算機 (saba、gyoku、gomoku) に関しては新システム移行後にサービスが継続して提供されることは保証されていません。 ●2008 年度で利用登録を終了する方、利用を一時停止する方 「2008 年度利用報告書、利用終了・一時停止届」をプリントアウトの上、必要事項を記入・捺印のうえ、ヒトゲノム解析センター宛にご送付ください。 ★★ 継続手続き期限 2008 年 3 月 24 日 (月) ★★ 【書類送付先・問合せ先】 〒108-8639 東京都港区白金台4 -6-1 東京大学医科学研究所 総合研究棟 8F 機能解析イン・シリコ分野 齊藤 Tel: 03-5449-5131 (内線: 75131) E-mail: register@hgc.jp

2008年02月18日 Pipeline Pilot 利用法講習会のお知らせ


2 月 26 日開催の「Pipeline Pilot 利用法講習会」の受講者受付を開始いたしました。 講習会内容、申し込み方法は下記をご参照ください。 https://supcom.hgc.jp/japanese/training/calender.html

2008年01月23日 スパコンシステム定期点検のお知らせ


電源設備の点検と、スーパーコンピュータシステムの定期点検の実施のため、下記の日程におきまして、スーパーコンピュータシステムのサービスを停止させていただきます。 電源設備の点検による停電時には、メールサービスがご利用いただけません。 皆様のご理解、ご協力の程よろしくお願いいたします。 システム停止日程: 2 月 23 日 (土) 9:00 ~ 25 日 (月) 9:00 メール停止日程: 2 月 23 日 (土) 13:00 ~ 23 日 (土) 17:00

2008年01月08日 SeqWeb のサービス停止 (1/15)


下記作業は完了いたしました。 (2008/1/15 15:00) SeqWeb データベース更新作業のため、1 月 15 日 (火) の午前 9 時から午後 10 時までの間、SeqWeb のご利用ができなくなります。 ご理解、ご協力の程、よろしくお願いいたします。

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